La lotta integrata è una pratica di difesa delle colture che prevede una drastica riduzione dell'uso di fitofarmaci mettendo in atto diversi accorgimenti. Tra i principali, si ricordano:

• l'uso di fitofarmaci poco o per niente tossici per l'uomo e per gli insetti utili;
• la lotta agli insetti dannosi tramite la confusione sessuale (uso di diffusori di ferormoni);
• fitofarmaci selettivi (che eleminano solo alcuni insetti);
• fitofarmaci che possono essere facilmente denaturati dall'azione biochimica del terreno e dall'aria;
• la lotta agli insetti dannosi tramite le tecniche di autocidio, come la tecnica dell'insetto sterile (SIT);
• la previsione del verificarsi delle condizioni utili allo sviluppo dei parassiti, in modo da irrorare con fitofarmaci specifici solo in caso di effettivo pericolo di infezione e non ad intervalli fissi a scopo preventivo.
• la lotta agli insetti dannosi tramite l’inserimento di altri che siano loro predatori naturali e che non siano dannosi alle coltivazioni (lotta biologica);
• l’uso di varietà colturali maggiormente resistenti;
• l’uso della rotazione colturale;
• particolare attenzione ed eliminazione di piante infette.
  

i limiti della lotta integrata sono costituiti dai maggiori costi di produzione, dalla necessità di una assistenza tecnica qualificata, e la obbiettiva difficoltà nel certificare il prodotto.La prima regione a creare un marchio di garanzia e tutela per i prodotti agroalimentari realizzati con tecniche di agricoltura integrata è la Toscana con il marchio “Agriqualità” (creato con legge regionale N.25 del 1999).

La lotta integrata parte dalla consapevolezza che quando si interviene in un ecosistema si alterno le reti trofiche. Sfrutta i fattori biotici e abiotici di regolazione interna agli ecosistemi a suo vantaggio e usa tutti gli strumenti possibili, non limitandosi quindi ai mezzi chimici (biologici, culturali, biotecnologici..). Questo approccio è prevalentemente usato nella lotta contro gli insetti, ma si può estendere nella lotte contro tutti gli organismi dannosi (funghi, roditori..). Il suo obiettivo è quello di mantenere l'organismo dannoso entro una soglia, limite oltre al quale l'organismo stesso crea danno economico (non vuole arrivare all'eradicazione, ma al contenimento).

Milano Ristorazione acquista per i bambini delle scuole di Milano, ogni anno, circa 415.000 kg di arance. Di queste, circa  kg 340.000 sono arance ottenute con sistemi di coltivazione a lotta integrata, e circa kg  75.000 sono arance ottenute con sistemi di coltivazione convenzionale. In entrambi i casi, dopo la raccolta le arance vengono trattate, al fine di permettere una maggiore conservazione, così come previsto dalla normativa europea, nello specifico dal Reg. CE n. 1799/2001 e successive modifiche. Se ne deduce che il legislatore ha preso in considerazione la possibilità di un consumo occasionale e sporadico dovuto alla sbucciatura del frutto, ed ha valutato che questo non costituisce rischio per la salute. (...)